天然物质也可能在一定浓度下造成危害，汞的不同化学形态具有不同环境行为

重金属是使用范围不完全一致的分类名称。金属的化学形态会显著影响迁移性与毒性。汞的不同化学形态具有不同环境行为。土壤酸度能够改变某些金属离子的可利用性。有机质可以通过络合影响金属在土壤中的迁移。大气污染物包括颗粒物与多类气态组分。细颗粒物的来源和化学组成可以十分复杂。二次颗粒物由气体前体物发生转化形成。

消毒用于降低水中某些微生物的活性。消毒效果与接触时间和消毒剂需求有关。氯消毒可能同时形成一定的消毒副产物。高级氧化过程利用活性物种转化难降解组分。污染物降解不一定立即意味着完全矿化。降解中间产物也需要根据具体性质评价。吸附处理把污染物转移到吸附材料之上。膜分离能够按尺寸电荷等特征截留组分。

生化需氧量反映规定条件下生物耗氧程度。化学需氧量依赖特定氧化方法测得的结果。不同耗氧指标不能简单相互替代使用。污水处理常组合物理化学与生物过程。混凝沉淀有助于去除部分胶体和悬浮物。活性污泥利用微生物群体转化有机污染物。硝化过程通常把铵态氮转化为氧化态氮。反硝化可以把某些氧化态氮转为气态产物。

光化学烟雾涉及氮氧化物与挥发性有机物反应。近地面臭氧可以作为重要的二次污染物。高空臭氧与近地面臭氧具有不同环境意义。酸沉降与硫氮化合物在大气中的转化有关。普通雨水本来就可能因溶入二氧化碳呈弱酸性。水体富营养化与氮磷输入过多等因素有关。藻类过度繁殖可能改变水体透明度和氧状况。有机物分解可以消耗水中的溶解氧。