天然物质也可能在一定浓度下造成危害，有机质可以通过络合影响金属在土壤中的迁移

重金属是使用范围不完全一致的分类名称。金属的化学形态会显著影响迁移性与毒性。汞的不同化学形态具有不同环境行为。土壤酸度能够改变某些金属离子的可利用性。有机质可以通过络合影响金属在土壤中的迁移。大气污染物包括颗粒物与多类气态组分。细颗粒物的来源和化学组成可以十分复杂。二次颗粒物由气体前体物发生转化形成。

海水淡化需要处理盐分分离与浓水排放问题。微塑料指一定尺寸范围内的塑料颗粒。微塑料可以来自大塑料破碎或直接颗粒来源。环境监测数据受采样时空尺度明显影响。一次测量不能完整代表环境长期变化趋势。背景浓度有助于理解某地区的自然基线。污染源解析常需要多种化学指纹与模型。绿色化学关注从源头减少有害物质生成。

生化需氧量反映规定条件下生物耗氧程度。化学需氧量依赖特定氧化方法测得的结果。不同耗氧指标不能简单相互替代使用。污水处理常组合物理化学与生物过程。混凝沉淀有助于去除部分胶体和悬浮物。活性污泥利用微生物群体转化有机污染物。硝化过程通常把铵态氮转化为氧化态氮。反硝化可以把某些氧化态氮转为气态产物。