投影式的旋转操作可能改变或保持原构型，对映异构体互为不可重合的镜像结构，绝对构型标记遵循规定的基团优先次序

哈沃斯投影常用于表示环状糖的结构。投影式的旋转操作可能改变或保持原构型。构型变化通常需要断键或经历特定反应过程。分子模型可以帮助辨认空间重合与镜像关系。手性轴也能使分子呈现稳定的对映结构。阻转异构来自受限旋转形成的可分离构型。立体结构描述必须明确所采用的表示约定。空间结构信息是理解生物分子识别的重要基础。

平面中间体的形成可能影响产物立体分布。烯烃加成的空间结果取决于具体反应机理。糖分子的多个立体中心产生丰富异构关系。氨基酸的立体构型影响蛋白质的空间结构。天然蛋白质主要由特定构型氨基酸组成。核酸糖环的立体结构影响遗传物质构象。楔线结构式用于表达纸面外的化学键方向。纽曼投影从指定碳碳键方向观察分子构象。

绝对构型标记遵循规定的基团优先次序。相对构型比较分子之间的空间关系。顺反异构可出现于受限旋转的结构之中。双键两端取代基不同可能形成几何异构。双键构型可以使用优先序规则加以标记。单键旋转可以产生不同的分子构象。构象异构通常不需要断开化学键即可互变。交叉构象与重叠构象具有不同的能量。