生物膜中的细胞可能具有不同于游离状态的性质，多数细菌的细胞壁包含具有支持作用的肽聚糖

并非所有古菌都只生活在极端环境中。嗜热微生物的蛋白质结构有助于高温稳定。嗜盐微生物通过渗透调节适应高盐条件。蓝细菌属于细菌而不是真核藻类。某些蓝细菌能够通过固氮补充可利用氮。微生物群落参与土壤与水体的物质循环。肠道微生物与宿主饮食和生理状态相互影响。微生物群落变化不一定直接证明因果关系。

菌毛可以参与细胞附着或遗传物质转移。细菌通常通过二分裂增加细胞数量。细菌繁殖速度受到温度与营养等条件限制。芽孢是某些细菌形成的高耐受休眠结构。芽孢形成并不是细菌增加个体数的生殖方式。细菌生物膜由附着细胞与胞外基质构成。生物膜中的细胞可能具有不同于游离状态的性质。群体感应通过化学信号协调部分群体行为。

病原性取决于微生物特征与宿主状态。条件致病菌可能在特定情况下引发问题。灭菌旨在清除包括耐受结构在内的微生物。消毒与灭菌的目标和处理强度有所不同。巴氏处理降低部分微生物而非实现完全灭菌。无菌操作帮助防止样品被外来微生物污染。微生物演化速度受到世代时间与环境影响。病毒需要利用宿主细胞系统完成增殖。