克隆个体并不保证所有表型完全相同：囊胚阶段形成特定的细胞排列与腔隙

克隆个体并不保证所有表型完全相同。生殖细胞谱系负责连接不同世代的遗传传递。发育中的表观遗传重编程重塑部分调控状态。器官大小受到细胞数量和单个细胞大小影响。形态稳定性依靠发育过程中的误差缓冲机制。演化发育生物学比较不同物种的发育机制。相似发育基因可以在不同结构形成中被重复利用。胚胎发育并非简单重演成年祖先的全部形态。动物行为包括运动交流学习与资源选择。

幼态延续可使成体保留某些祖先幼体特征。发育异时性指发育事件时间或速率的演化改变。发育可塑性使相同基因型产生不同环境响应。关键期内的环境因素可能留下长期影响。母源物质能够影响胚胎最早期的发育过程。胚胎自身基因组在特定阶段开始广泛表达。双胞胎可以来自一个或两个受精卵来源。同卵双胞胎也可能因环境形成部分差异。

胎盘交换不意味着母体与胎儿血液完全混合。卵黄为许多动物的早期发育提供营养。卵生胎生与卵胎生代表不同生殖发育方式。变态过程涉及幼体组织重塑与成体结构形成。两栖动物变态受到激素与环境共同影响。昆虫蛹期包含活跃而复杂的组织重建。直接发育不经历明显的自由生活幼体阶段。间接发育包含与成体差异显著的幼体阶段。

组织张力与机械作用参与胚胎形状变化。器官发生依靠多类细胞协调构建结构。神经管形成是许多脊椎动物发育的重要步骤。脊索能够为周围组织提供诱导信号。体节参与形成脊椎动物部分轴向组织。肢芽发育整合多个方向的位置信息。左右不对称发育使内部器官形成特定排列。胎盘在部分哺乳动物中连接母体与胚胎。