残余熔体可能因此富集部分不相容元素，氧化还原条件影响铁锰等元素的存在形态，矿物中的微量元素可以记录形成环境信息

氧化还原条件影响铁锰等元素的存在形态。缺氧环境可以促进某些还原态物质积累。沉积物孔隙水记录早期成岩化学过程。成岩作用在埋藏过程中改变沉积物性质。有机质保存程度受到氧供应和埋藏速度影响。化石燃料形成需要长期的地质转化条件。石油与天然气主要由复杂有机物地质演化形成。

锆石可以保存古老的地质年龄和化学记录。包裹体能够保存矿物形成时的流体信息。陨石组分有助于认识太阳系早期物质组成。宇宙尘埃也会持续向地球输入少量物质。元素迁移受溶解度吸附与配位等共同控制。地下水中的化学反应会改变水质和矿物组成。地球化学模型需要约束温度压强及反应条件。自然样品常保留多期过程叠加形成的记录。

地球化学循环连接岩石水体大气与生命活动。亲石元素倾向于进入硅酸盐等含氧矿物。亲铁元素在特定条件下较易进入金属相。亲硫元素常与硫化物矿物存在密切关系。元素分类反映特定地球化学条件下的分配倾向。岩浆分异可以使不同矿物逐步分离结晶。不相容元素较难进入某些早期结晶矿物。